多角形を円と円弧の上に変更してOKを押し、念のためプロジェクトの保存を行ってから再度Quadceptを開き直して部品を配置してみたところうまく表示されました。しかし部品とシンボルのプレビューの表示は直っていませんでした。

設定の描画優先を開くと元の順序に戻っており、設定保存のボタンを見落としていることに気がつきましたので、「初期環境設定に保存する」を行ったところプレビューの表示も直りました。

ややこしいので、やはり図形を重ねて使用することは避けたほうがよさそうですね。

自己解決されたようなので、今後は、初期環境設定に保存いただき、図形を重ねて配置した物を確認いただけましたら幸いです。

ただ描画優先の設定に限らず、初期環境設定は、バージョンアップの際に、機能が付かされたことにより、データ構造が変わる事が、

時々発生いたします。その時、構造が変わった部分がリセットされる事がございますので、アップデートの際はご注意いただけますと幸いです。