DRCの「動的ベタ接続」の「SMD」設定では「サーマル」発生に設定してありますが、PCB内の一部のパッドではサーマル発生したくないので、対象パッドを選択し「パッド」ウィンドウの「デザインルール」タブで「デザインルールを適用」のチェックを外し、「サーマル設定」で「ベタ」を選択し個別設定しています。

現在、ベタ設定にしたいパッドの一つ一つについて上記操作で設定していますが、複数のパッドを選択しベタ接続設定にする方法はないでしょうか？

複数パッドを選択した状態でのプロパティウィンドウで「デザインルール」を「無効」にはできますので、「パッド」ウィンドウの「デザインルールを適用」のチェックを外した時に現れる「サーマル設定」のデフォルト設定を「各種設定」のどこかで指定できるとか、プロパティウィンドウで直接設定できるといいのですが。