先ほどの添付ファイルのリレーは自分でコイルと接点をシンボルグループとして登録した部品なのですが、接点側のリファレンスをK3/B⇒K2/Bに書き換えると、なぜか自動的にコイル側がK2/A⇒K3/Aに変わってしまい、何度繰り返しても同じリファレンスに揃える事が出来ませんでした。しかし、別の部品で試すと同じリファレンスを揃えられる部品もあり、自分でも違いが良く分からなくなりました。

もう少し試して症状を整理してから改めて質問した方が良いように思いますが、もしこの時点で何かアドバイスを頂けるようであればお願い致します。

問題となった部品には二つのシンボルグループを作っており、当初同じシンボルグループのAとBを配置していたのですが、途中で片方のシンボルグループが変わっていた（間違って配置した）ようです。つまりシンボルグループ1のシンボルAとシンボルグループ2のシンボルBを配置していたために、二つのシンボルのリファレンスを揃える事が出来なかったみたいです。配置する部品のシンボルグループを統一（片方のシンボルを消して再配置）した後はリファレンスを自由に設定できるようになりました。

お騒がせしました。。。。