お問い合わせありがとうございます。

Quadceptでは部品としてライブラリ登録しなくても、フットプリントを直接配置して設計できるという機能がございます。
そのため、部品の高さ情報は部品ではなく、フットプリント(正確には部品領域)に設定する仕様とさせて頂いております。

ご指摘のように、高さ違いの同形状の部品につきましては、高さ毎にフットプリントを作成して頂きますようお願いいたします。
簡易的な方法でしたら、配置後の部品であれば個別に高さを変更することも可能ですので、用途に合わせてご対応ください。
お手数をおかけいたしますが、よろしくお願いいたします。